|
|
Čipová a kapilární elektroforéza pro výzkum rakoviny
Hájková, Tereza ; Babula, Petr (oponent) ; Provazník, Ivo (vedoucí práce)
Práce se zabývá problematikou nádorového onemocnění a jeho vznikem. Karcinom prostaty je druhý nejzávažnější karcinom u mužů, je důležité zaměřit se na včasnou detekci. Tato práce pojednává o proteinech, které jsou nebo by mohly být využity jako potenciální nádorové markery. Například v současnosti běžně používaný prostatický specifický antigen, ale nově i metalothionein. Metalothionein je protein vyskytující se v rostlinné i v živočišné říši ve čtyřech základních isoformách. Existuje předpoklad, že obsah jednotlivých isoforem, případně jejich vzájemný poměr, má určitý diagnostický potenciál, který by mohl být využitelný v praxi. Z tohoto důvodu jsou vyvíjeny a studovány metody pro specifickou a citlivou analýzu jednotlivých isoforem. V této práci je pro separaci isoforem využita kapilární elektroforéza a jsou diskutovány vlivy jednotlivých parametrů (druh základního elektrolytu, jeho pH, velikost separačního napětí a tak dále) na výslednou separaci.
|
|
|
MR vyšetření prostaty a statistická úspěšnost navigované biopsie prostaty
HEFLER, Jakub
Karcinom prostaty je velmi závažným a častým onemocněním jak ve světě, tak i v České republice. Incidence v roce 2018 byla 62,5 na 100 000 obyvatel napříč Českou republikou. V současné době incidence i mortalita mírně klesá. Diagnostika karcinomu prostaty se zahajuje pohmatovým vyšetřením per rectum. Dále pak odběr na PSA. Pokud je tato hodnota vysoká, je pacient odeslán na biopsii prostaty, která se provádí pod ultrazvukovou kontrolou. Přesnějšímu zacílení prostaty pomáhá obrazová fúze. To znamená, že si urolog připojí obrazy z magnetické rezonance do ultrazvukového přístroje. Neodebírá se tzv. na slepo. Při navigované biopsii prostaty je odebráno cca 10-12 vzorků, a ty jsou vyšetřeny na patologii pomocí histologického vyšetření. Patolog podle Gleasonova skóre určí na stupnici 1-5 (1 = nejlépe diferencovaný, 5 = nejhůře diferencovaný) diferenciaci a typ karcinomu prostaty. Lékaři karcinomy prostaty hodnotí také podle PI-RADS 2.1 systému, který určí riziko výskytu karcinomu prostaty. Tento sytém také využívá škálu od 1 do 5 (1 = velmi nízká pravděpodobnost, 5 = velmi vysoká pravděpodobnost). Navigovaná biopsie prostaty se provádí od hodnocení PI-RADS 4-5. Pro svou bakalářskou práci jsem použil data ke zpracování statistiky z nemocničního informačního systému Nemocnice České Budějovice z urologického oddělení. Zajímal jsem se o pacienty, kteří zde byli vyšetřování v posledních dvou letech, a to od dubna 2019 do června 2021. Za toto období bylo vyšetřeno celkově 288 mužů. Z toho byl proveden náhodný výběr 45 pacientů pro určení statistické úspěšnosti navigované biopsie prostaty pomocí magnetické rezonance. Cíle práce byly: 1. Vytvoření informačního textu obsahujícího anatomický a funkční popis prostaty, podstatu magnetické rezonance a její využití u vyšetření prostaty a deskripci navigované biopsie prostaty. 2. Stanovení statistické úspěšnosti navigované biopsie prostaty spomocí magnetické rezonance. Byly stanoveny následující hypotézy: H1: Pokud dojde k nekorespondenci prvotních výsledků laboratorních a histologických ohledně karcinomu prostaty, je u většiny pacientů indikováno bioptické vyšetření prostaty s použitím magnetické rezonance. H2: U více než 80 % pacientů je potvrzen karcinom prostaty po odebrání histologických vzorků s využitím magnetické rezonance. Došlo k sestavení informačního textu, který obsahuje základy principu magnetické rezonance a diagnostiky karcinomu prostaty společně s MR navigovanou biopsií prostaty - byl tedy splněn cíl číslo 1. Cíl číslo 2 byl taktéž splněn, jelikož byl statisticky určen poměr pozitivních a negativních výsledku navigované biopsie. Tento poměr byl 73% pozitivních a 27% negativních nálezů. Je nutné tedy zamítnout hypotézu H2. Hypotézu H1 můžeme přijmout dle informací od MUDr. Černého, který tyto biopsie provádí v Nemocnici České Budějovice a.s.
|
|
|
Možnosti využití pokročilých MR technik při zobrazování malé pánve
Ryznarová, Zuzana ; Malíková, Hana (vedoucí práce) ; Büchler, Tomáš (oponent) ; Lisý, Jiří (oponent)
(ČJ) Práce byla zaměřena na tři dílčí cíle: 1. Porovnání výsledků magnetické rezonance (MR) prostaty s histopatologickým nálezem po radikální prostatektomii u pacientů s biopticky potvrzeným karcinomem prostaty (PCa) a zhodnocení přesnosti lokálního stagingu a přesnosti v určení lokalizace tumoru v prostatě. Na skeneru 1,5 T a 3 T bylo konsekutivně vyšetřeno 103 pacientů (ve věku 44-72 let), kteří byli rozděleni do 3 skupin (A, B, C). Pacienti z prvních dvou skupin (A a B) byli vyšetřeni na skeneru 1,5 T (A) a 3 T (B) s povrchovou cívkou v protokolu multiparametrického MR zobrazení včetně dynamického kontrastního zobrazení (DCE), skupina C byla vyšetřena na skeneru 3 T ve stejném protokolu bez DCE. Nejvyšší přesnost v predikci stadia PCa byla u pacientů vyšetřených na skeneru 3 T při zahrnutí DCE do vyšetřovacího protokolu, rozdíl mezi 1,5 T a 3 T nebyl statisticky významný. V přesnosti určení lokalizace tumoru v prostatě nebyl rozdíl mezi skupinami, ale statisticky významný rozdíl byl mezi použitými sekvencemi. Nejlepších výsledků bylo dosaženo při použití kombinace T2 vážených sekvencí s difúzně váženým zobrazením. 2. Další část byla zaměřena na zjištění věkové závislosti koncentrace metabolitů citrátu, cholinu, kreatinu a sperminu v prostatě u zdravých dobrovolníků s využitím protonové (1 H) MR...
|
|
|
Charakterizace vedlejší populace buněčné linie TRAMP-C2, myšího modelu karcinomu prostaty"
Žlabová, Anna ; Reiniš, Milan (vedoucí práce) ; Šmahel, Michal (oponent)
Vedlejší populace (side population, SP) je minoritní subpopulace některých buněčných linií, která ze své cytoplasmy exportuje Hoechst 33342. U nádorů je diskutována jako možný zdroj "nádorových kmenových buněk", "tumor zakládajících buněk" či "metastázy zakládajících buněk". Povšechná literatura však zjevně svědčí pro to, že kmenovost či další privilegované vlastnosti buněk SP jsou značně individuální pro různé buněčné typy, buněčné linie a stadia onemocnění. Pro testování terapie karcinomu prostaty jsou linie TRAMP jediné široce dostupné myší modely. V literatuře jsme zaznamenali zmínku o existenci 1-2% buněk tvořících vedlejší populaci TRAMP-C2, avšak detailní charakteristika této vedlejší populace dosud popsána nebyla. V rámci diplomové práce jsme pracovali na charakterizaci SP buněčné linie TRAMP-C2, kterou jsme srovnávali s populací ostatních buněk (nonSP). V první části práce jsme porovnávali SP a nonSP z hlediska kmenových vlastností. Nejdříve jsme ověřili existenci SP potvrzením její senzitivity k verapamilu. Vyšetřením mRNA jsme prokázali, že SP ani nonSP nemají zvýšenou expresi c-Kit a neliší se v expresi Bmi-1. Dále jsme zjistili, že je SP heterogenní směsí CD24-CD44-, CD24-CD44+ a CD24+CD44+ buněk, zatímco nonSP je téměř výhradně CD24-CD44+. Po vysortování buněk jsme vysledovali, že se...
|
|
| |
|
|
Diagnostický algoritmus karcinomu prostaty
Sedláčková, Hana ; Hora, Milan (vedoucí práce) ; Baxa, Jan (oponent) ; Záleský, Miroslav (oponent)
v českém jazyce Cíl: Cílem práce je implementace nejnovějších vědeckých poznatků v diagnostice karcinomu prostaty (KP). Zaměřili jsme se na laboratorní markery, zobrazovací metody, metodiku biopsie prostaty a sestrojili jsme diagnostický algoritmus založený na přehledu současné literatury v kombinaci s našimi vlastními zkušenostmi. Materiál a metody: Algoritmus je členěn na několik odvětví, které byly jednotlivě podrobeny klinickým studiím. Vzhledem k nízké senzitivitě a specificitě PSA, byl v první stratifikaci pacienta přidán index zdravé prostaty (PHI). Primárně bylo vyšetřeno a následně podstoupilo radikální prostatektomii 787 pacientů. Hladiny PHI byly porovnány s definitivním stagingem a gradingem. Byly stanoveny cut-off hodnoty pro detekci KP, ale též pro další stratifikaci high-risk včetně lokálně pokročilého KP. V další studii bylo 320 pacientů, kteří podstoupili biopsii prostaty a následně radikální prostatektomii. Soubor byl dále rozdělen do dvou podskupin, pacienti s GS = 6 a pacienti s GS > 6. PHI bylo hodnoceno s cílem odlišení signifikantního a insignifikantního KP. V multicentrické studii se 395 pacienty bylo posuzováno PHI s dalšími markery (tPSA, PSAD) a s multiparametrickou magnetickou rezonanci (mpMR) prostaty. V další studii o 472 pacientech byl PHI hodnocen s ostatními...
|
|
|
Perineurální šíření pánevních nádorů: mechanismus a diagnostika
Čapek, Štěpán ; Sameš, Martin (vedoucí práce) ; Haninec, Pavel (oponent) ; Hořínek, Daniel (oponent)
Perineurální šíření pánevních nádorů mechanismus a diagnostika Abstrakt Nádorová onemocnění plexus lumbosacralis jsou relativně vzácná a v případech s minimálním nebo neurčitým nálezem na zobrazovacích metodách může být stanovení správné diagnózy velmi zdlouhavé. V této práci popisujeme skupinu pacientů s perineurálním šířením nádoru pánevních orgánů od primárního ložiska podél autonomních nervů do plexus lumbosacralis a dále proximálně do spinálních nervů či intradurálně nebo naopak distálně do n. ischiadicus. Na souboru 17 pacientů s diagnózou perineurálního šíření nádorů pánevních orgánů popisujeme charakteristickou anamnézu, fyzikální nález a nález na zobrazovacích metodách. Diagnostika se v těchto případech opírá o nález na zobrazovacích metodách a výsledek biopsie plexus lumbosacralis nebo n. ischiadicus. Tato práce popisuje operační techniku cílené fascikulární biopsie n. ischiadicus a na souboru 117 pacientů s biopsií n. ischiadicus úspěšnost, výsledky a komplikace. Diagnostická výtěžnost byla 84.8 % a frekvence komplikací byla 2.7 %. Pokud je ke stanovení diagnózy nezbytný vzorek tkáně, cílené biopsie periferních nervů vedou k vyšší diagnostické výtěžnosti s přiměřeným rizikem komplikací. Perineurální šíření pánevních nádorů je nová klinicko-patologická jednotka, o které zatím nemáme dostatek...
|
|
|
Adoptivní transfer tumor-specifických lymfocytů v imunoterapii nádorových onemocnění
Vávrová, Kateřina ; Bartůňková, Jiřina (vedoucí práce) ; Němečková, Šárka (oponent) ; Reiniš, Milan (oponent)
Karcinom prostaty je druhou nejčastější příčinou úmrtí mužů na rakovinu v Evropě a USA. V kontextu dosavadních preklinických experimentů a klinických studií existují předpoklady pro úspěšné uplatnění imunoterapie v jeho léčbě. Slibných výsledků je dosaženo převážně kombinací různých léčebných modalit, kdy dochází k jejich synergickému protinádorovému působení. Jednou z možností je využití protinádorových vakcín a adoptivního T buněčného transferu. Téma této dizertační práce navazuje na dlouhodobý výzkumný program pracoviště kandidátky v oblasti protinádorové imunoterapie. Obecná část dizertační práce podává základní přehled o mechanismech protinádorové imunity a o roli jednotlivých složek imunitního systému při jejím zajištění. Další části se věnují současným imunoterapeutickým přístupům s důrazem na metodu adoptivního T buněčného transferu a jejího uplatnění v léčbě karcinomu prostaty. Ve vlastní výzkumné části předkládá vypracovaný experimentální protokol pro adoptivní transfer tumor specifických T lymfocytů, a dále protokol zabývající se ex vivo obohacením buněčných populací o peptid-specifické T lymfocyty u pacientů s karcinomem prostaty. V rámci našeho výzkumu uvádíme též výsledky klinické studie, která si kladla za cíl ověřit biologickou bezpečnost, schopnost indukce imunitní protinádorové...
|
|
|
Studium vlivu sarkosinu na kalmodulinem-zprostředkovanou vnitrobuněčnou signalizaci
Gerych, Tomáš
Následující diplomová práce s názvem Studium vlivu sarkosinu na kalmodulinem-zprostředkovanou vnitrobuněčnou signalizaci je věnována analýze dosavadních zjištění v oblasti vlivu zvýšené hladiny sarkosinu na vnitrobuněčnou signalizaci zprostředkovanou kalmodulinem a kalmodulin dependentními kinasami a experimentálnímu ověření zjištěných skutečností na tkáňových kulturách nádorových a nenádorových buněk prostaty. Předpokladem k vypracování této práce je možné využití sarkosinu jako potenciálního markeru karcinomu prostaty. V případě potvrzení jeho využití jako markeru tohoto onemocnění by se mohla zjednodušit a zefektivnit diagnostika karcinomu prostaty díky dostupnosti jednoduchých domácích testů reagujících na hladinu sarkosinu v moči testovaného jedince.
|
|
|
Studium vlivu nízkomolekulárních metabolitů na expresi mRNA kódující enzymy metabolismu sarkosinu
Vopařilová, Petra
Má bakalářská práce pod názvem „Studium vlivu nízkomolekulárních metabolitů na expresi mRNA kódující enzymy metabolismu sarkosinu“ se zabývá studiem sarkosinu a jeho metabolismu spojeného se vznikem a rozvojem nádorového onemocnění prostaty. V dané práci byl studován vliv exogenního sarkosinu na expresi genů kódujících enzymy metabolismu sarkosinu, mezi které patří glycin N-methyl transferáza (GNMT), sarkosin dehydrogenáza (SARDH), sarkosin oxidáza (PIPOX) a dimethylglycin dehydrogenáza (DMGDH). Snažili jsme se zjistit, do jaké míry je ovlivněna exprese těchto genů u nenádorové prostatické linie PNT1A a dvou nádorových buněčných linií DU-145 a PC-3. Tato práce byla zahájena kultivací buněčných linií na specifickém médiu s přídavkem exogenního sarkosinu. Po 24. hodinové inkubaci byla provedena izolace RNA s následným ověřením její čistoty a integrity. Poté byla RNA přepsána do cDNA pomocí reverzní transkripce, a nakonec byla provedena relativní kvantifikace genové exprese pomocí qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green. Výsledky byly statisticky zpracovány pomocí Studentova nepárového t-testu. Po aplikaci 10 µM sarkosinu jsme nepozorovali žádné signifikantní změny v expresi sledovaných genů. Až po aplikaci 50 µM sarkosinu jsme pozorovali signifikantní nárůst exprese SARDH, PIPOX a DMGDH, tedy genů, které se podílejí na degradaci sarkosinu. Tento efekt byl však zjištěn pouze u nenádorové linie PNT1A, nikoliv však u nádorové line PC-3.
|
host ::
RSS.